Във връзка с настъпили промени в нормативната уредба, следващи от § 3 от Допълнителните разпоредби на ПМС № 162/2016 г., § 9 от Преходните и заключителните разпоредби на ПМС № 160/2016 г., § 3 и § 8 от Преходните и заключителните разпоредби на ПМС № 189/2016 г., и § 2, т. 2 от Допълнителните разпоредби на Наредба за администриране на нередностипо европейските структурни и инвестиционни фондове (приета с ПМС № 173 от 13.07.2016 г., обн., ДВ, бр. 57 от 22.07.2016 г.), със Заповед №РД-16-863/02.09.2016 г. на ръководителя на Управляващия орган са направени изменения в:

1. Условията за кандидатстване
2. Критерии и методология за оценка на проектни предложения
3. Декларация за нередности
4. Условията за изпълнение
5. „Общи условия към финансираните по Оперативна програма “Иновации и конкурентоспособност” 2014-2020 административни договори за предоставяне на безвъзмездна финансова помощ“